İlk olarak erkek kısırlığı tedavisi için geliştirilmiş bir yöntemdir. Spermin normal dölleme özelliğine sahip olmaması durumunda döllenmenin sağlanması amacı ile uygulanır. Şiddetli erkek kısırlığına yol açan durumlarda tüp bebek yöntemi de dahil olmak üzere bilinen diğer tedavi yöntemleri ile döllenme olmamakta veya çok düşük oranda gerçekleşmektedir. Mikroenjeksiyon, son yıllarda kısırlık tedavisinde devrim yaratmış olup, daha önceden tedavi şansı verilmeyen birçok çift bu yöntemle çocuk sahibi olmuştur (Resim 1-2-3). Mikroenjeksiyon yönteminde, sperm bir mikroenjektör yardımı ile yumurtanın içine enjekte edilmektedir. Bu sayede zayıf hareketli ve şekli bozuk spermlerin bile yumurtayı döllemesi sağlanır. Zira döllenme işlemi asıl olarak spermin yumurta içine girmesidir. Sağlıklı spermler bunu kendileri yapabilirken, problemli spermlere mikroenjeksiyon işlemi sayesinde yardım edilmektedir. Şekli bozuk spermler ile oluşan gebeliklerin sakat olup olmayacağı sıkça sorulan sorular arasındadır. Bugüne kadar yapılan araştırmalar göstermektedir ki, bu tür bir risk artışı söz konusu değildir. Tüp bebek ve mikroenjeksiyon işlemleri sonucu elde edilen bebeklerin küçük veya büyük bir sakatlığa sahip olma riskleri kendiliğinden olan gebeliklerdeki ile aynıdır.